 |  | Theo Dingermann |
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04.05.2020 13:24 Uhr |
Die Struktur lässt erkennen, dass umfangreiche Protein-RNA-Interaktionen zwischen dem Matrizen-Primer-RNA-Komplex und nsp12 ausgebildet werden. An den meisten dieser Interaktionen sind die Reste des RNA-Ribosephosphat-Rückgrats beteiligt. Vielen Interaktionen werden direkt an den 2′-OH-Gruppen ausgebildet, um zwischen RNA und DNA zu diskriminieren.
Am 3‘-Ende des Primerstrangs ist Remdesivir-Monophosphat (RMP) kovalent gebunden. Trotz des Vorhandenseins von überschüssigem Remdesivir-Triphosphats ist nur ein einziges Remdesivir-Monphosphat in den Primer-Strang eingebaut. Dies ist ein klarer Hinweis darauf, dass Remdesivir, ebenso wie viele andere Nukleotidanaloga, die virale RdRp-Aktivität durch nicht-obligate RNA-Kettenterminierung hemmt.
Die Strukturanalyse zeigt, dass die SARS-CoV-2-RdRp ein relativ stabiles Enzym ist, das nach Bindung einer RNA-Matrize unmittelbar mit der Replikation beginnen kann. Pro Sekunde baut die virale RdRp bis zu 100 Nukleotide in die wachsende RNA-Kette ein.
