In der Nationalversammlung der Paulskirche gehörte er der Fraktion der äußersten politischen Linken an und erwarb sich den Ruf des »radikalsten Linksaußen« des gesamten Parlaments. Er war ein auffälliger Diskutant und nahm kein Blatt vor den Mund, was ihm regelmäßig Ordnungsrufe einbrachte. Ab Mai 1849 nahm Schlöffel am badisch-pfälzischen Aufstand teil, weshalb er im November in die Schweiz flüchtete und von dort 1850 »wegen politischer Gefährlichkeit« ausgewiesen wurde. Er emigrierte in die USA und wurde Gastwirt in Philadelphia. 1851 verurteilte ihn das Schwurgericht in Zweibrücken wegen Hochverrats zum Tode. Nach seiner Begnadigung 1866 kehrte er noch im selben Jahr nach Schlesien zurück, blieb seinen politischen Idealen aber zeitlebens treu.
Neben Schlöffel waren zwei weitere Apotheker im Paulskirchen-Parlament: Adolph August Hirschberg (1804–1885) und Eduard Vogel (1806–1868). Auch sie vertraten das linke politische Spektrum. In späteren Parlamenten waren die Apotheker jedoch deutlich konservativer. So gehörten von den zwölf seit 1949 im Deutschen Bundestag vertretenen Pharmazeuten sechs der CDU, zwei der SPD, zwei der FDP und je eine Person Bündnis 90/Die Grünen beziehungsweise Die Linke an.